Dans le monde secret de Gensokyo vivent harmonieusement les humains et les youkai. Reimu Hakurei est la prêtresse chargée de surveiller la barrière séparant Gensokyo et notre monde. Chaque été, elle invite dans son temple tous les habitants du Gensokyo pour y festoyer... Mais cette année, alors que l'été approche, l'autel à offrandes du temple Hakurei a disparu !