L’histoire se déroule en 1866 (ère Bakumatsu), en plein complot lorsque les Ishin Shishi (nationalistes qui veulent le retour de l’empereur au pouvoir) vont essayer de renverser le shogunat Tokugawa.
Nous suivons Ryo, un jeune samouraï qui combat au côté de Hijikata Toshizo, maître stratège et tacticien du Shinsengumi (redoutable milice du shogunat).